【摘要】 利用串联角色塑造质谱测定法(MS/MS)对生物低聚物进行分析和测序的发展促进了地球上生命化学的发展。

定量和强大的高分辨率(HR) MS 仪器的出现,同时记录 HR 全面扫描,允许分析师进一步超越采购前的选择和有针对性的分析[1]。使用相同的 HRMS 仪器,有针对性和非针对性的数据,常规和研究,可以进行定量或定性分析,并可以揭示外源性和内源性化合物的存在,水平或命运。在使用 HRMS 的常规实验室中,很容易获得全局和非目标数据,但数据通常以有针对性的方式处理,以量化预期的化合物。然而,当作为非靶向处理时,这个大数据可能揭示特定样品中感兴趣的未预测的化合物[2]

 

通常,全球和非目标LC-HRMS 采集允许分析人员分别在代谢组学和筛选实验室(通常是涉及食品安全,废水,环境,安全,反兴奋剂,法医和毒理学分析的实验室)中揭示生物标志物和有毒/非法化合物。更进一步,在临床实验室,非目标分析也可以应用于患者的血液样本,以揭示意想不到的化合物或意想不到的水平进行初步诊断尝试。

 

利用串联角色塑造质谱测定法(MS/MS)对生物低聚物进行分析和测序的发展促进了地球上生命化学的发展。生物低聚物可以在比任何合成混合物更复杂的分析物中以序列水平分辨率进行鉴定,这得益于已有的碎裂特性知识和几十年来建立的广泛的 MS/MS 数据库。然而,未知物分析仍然难以表征,因为没有可比较的数据库存在,部分原因是巨大的化学多样性和碎裂途径。在这里,我们提出低聚物汤测序(OLIGOSS) ,一种新的方法测序未知的低聚物系统。OLIGOSS 使用一组新颖的骨架不可知的抽象特性来定义碎片,它能够对任何适合 MS/MS 的线性低聚物类进行测序,而不管骨架化学如何。我们通过测序合成肽、聚酯、多亚胺和去脂肽寡聚物,定位 RNA 甲基化酌位点,以及直接从细胞裂解物中合成的核糖体肽硫代全酰胺来验证 OLIGOSS,这些肽没有提纯。

 

  • Amiri-Dashatan, M. Koushki, H.-A. Abbaszadeh, M. Rostami-Nejad, M. Rezaei-Tavirani,Proteomics applications in health: biomarker and drug discovery and food industry,Iran. J. Pharm. Res., 17 (2018), pp. 1523-1536.
  • G. Forsythe, S.S. Yu, I. Mamajanov, M.A. Grover, R. Krishnamurthy, F.M. Fernández, N.V. Hud,Ester-mediated amide bond formation driven by wet-dry cycles: a possible path to polypeptides on the prebiotic earth,Angew. Chem. Int. Ed. Engl., 54 (2015), pp. 9871-9875

 

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